臺灣是位於中國大陸東南方的海島，西側距離陸地約150公里，東鄰西太平洋。全島氣候溫和潮濕，年均溫約18度，年雨量平均2500 公釐。總面積約三萬六千平方公里，多山地而平原狹小；中央山脈縱貫全島，有三分之一的陸地海拔超過一千公尺，最高峰的海拔將近四千公尺。
中央山脈是大氣氣團移動的大障礙，成為主控東西坡地之氣候與生態的重要因素。此外，夏季常有颱風，此亦為模塑臺灣生態系的重要自然干擾力量；例如1996年7月31日到8月1日賀伯颱風過境期間，阿里山的降雨量便高達近二千公釐。本島的其他自然干擾尚有頻繁的地震與地滑、高土壤沖蝕率等，此皆與板塊運動所造成的地殼快速隆升有關。
土地利用類型的變遷與環境污染，則是兩大項人為因素對自然生態系的干擾。有關上述自然因素與人為活動對生態系的影響，至今仍缺乏有系統的研究。
林地約佔臺灣總面積的58%，故森林生態系為本島主要的自然陸域生態系；而由於地殼快速隆升，且地層多為固結性差的沈積岩，湖泊與沼澤生態系的面積與數量則較少。因此長期生態研究網的五處試驗地中，有四處為森林生態系，而一處以天然沼澤為主；此五處試驗地在地理位置、地質、氣候、植群型上各有不同，可作為臺灣重要自然生態系的代表。
中央山脈是大氣氣團移動的大障礙，成為主控東西坡地之氣候與生態的重要因素。此外，夏季常有颱風，此亦為模塑臺灣生態系的重要自然干擾力量；例如1996年7月31日到8月1日賀伯颱風過境期間，阿里山的降雨量便高達近二千公釐。本島的其他自然干擾尚有頻繁的地震與地滑、高土壤沖蝕率等，此皆與板塊運動所造成的地殼快速隆升有關。
土地利用類型的變遷與環境污染，則是兩大項人為因素對自然生態系的干擾。有關上述自然因素與人為活動對生態系的影響，至今仍缺乏有系統的研究。
林地約佔臺灣總面積的58%，故森林生態系為本島主要的自然陸域生態系；而由於地殼快速隆升，且地層多為固結性差的沈積岩，湖泊與沼澤生態系的面積與數量則較少。因此長期生態研究網的五處試驗地中，有四處為森林生態系，而一處以天然沼澤為主；此五處試驗地在地理位置、地質、氣候、植群型上各有不同，可作為臺灣重要自然生態系的代表。
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